胎牛血清的常規儲存溫度為-20℃，若需長期保存，則建議在-80℃條件下存放。在解凍時，不建議將血清直接置于常溫（25-37℃）中，這可能導致絮狀沉淀的產生，從而影響血清的品質。推薦的解凍步驟是先將其從-20/-80℃轉移至4℃，待完全液化后，再將其從4℃轉移至室溫。在解凍過程中，應持續輕輕搖動，確保血清成分和溫度均勻混合，以減少沉淀的發生。
解凍后的胎牛血清可以使用15mL或50mL無菌離心管分裝并重新凍存。根據使用頻率，可以選擇將一管已解凍的血清存放于4℃，以便于經常配制培養基。然而，不建議在4℃下存放過久，最好在一個月內用完。解凍后的血清不應在37℃或室溫下存放太久，以避免重要的細胞生長因子的失活影響細胞狀態。
在添加血清時，通常不宜過量，添加量為5%、10%或20%較為普遍。大部分細胞的正常培養使用10%的血清濃度，而部分細胞在原代提取時使用20%血清。具體適應的血清濃度需根據細胞特性和實驗目的進行探索。
關于熱滅活，通常以56℃，30分鐘處理解凍后的血清，此加熱步驟可促使補體去活化，補體參與的反應包括溶細胞活性、平滑肌收縮、肥大細胞和血小板組胺釋放、增強吞噬作用及淋巴細胞、巨噬細胞的趨化和激活。盡管有些特殊實驗要求需進行熱滅活，但對一般細胞培養而言，此步驟通常并非必要。經過熱滅活處理的血清對細胞生長的促進作用有限，反而可能因高溫導致血清質量下降，進而影響細胞生長速率和增加沉淀物。
在細胞培養過程中，經常需要更換血清。當使用新類型血清配制的培養基直接用于細胞培養時，可能會觀察到細胞增殖速率突然變慢或逐漸脫落的現象。這通常是因為細胞已適應其現有培養環境。即使新的血清質量更好，細胞也可能因不適應突變的營養環境而出現問題。因此，建議在更換血清時采取梯度替換的方法，以確保細胞能夠順利適應新環境。初次更換時，建議按照1:3的比例替換，隨后依次為1:1、3:1，最后實現完全替換。對于對培養體系敏感的細胞，替換比例應進一步細化。
如在解凍后發現少量乳白色絮狀或點狀物質，這些主要是由于血清中的脂蛋白變性和纖維蛋白所致，并不會影響血清的質量。可以通過400×g離心5分鐘取上清液，通常不會對細胞產生顯著影響。
一般情況下，廠家提供的血清為無菌，無需再次過濾。如發現血清中有懸浮物，可將血清與培養液一同過濾，但切忌直接過濾血清。如果在細胞培養過程中出現黑點，首先要仔細檢查培養基是否混濁，黑點是否出現不規則游動。如果細胞發生污染，微生物會大量繁殖，導致培養基迅速變黃、混濁。污染可能來源于細菌、支原體等。如果在顯微鏡下觀察到細胞狀態良好，與黑點出現前無變化，則黑點可能由以下因素造成：(1) 細胞在生長過程中自然破碎的細胞殘骸；(2) 血清中的雜蛋白，可能因反復凍融而出現；(3) 配制培養基的水質或容器不合格。可以通過離心或過濾的方法去除這些黑點；(4) 原代細胞中若出現小黑點，可能是原代組織中的雜質，通常多次傳代可消除。
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