一、模板質(zhì)量問題:
1)模板提取不完整,可能不包含目標(biāo)基因,或目標(biāo)基因含量過低。建議進(jìn)行電泳檢測,以觀察提取的DNA中PCR陽性樣品與陰性樣品之間的差異。如果確認(rèn)存在此類問題,可嘗試增加模板的量,但效果不一定顯著。
2)模板中可能殘留試劑成分,抑制Taq聚合酶的活性。在這種情況下,可以考慮使用試劑盒對(duì)模板進(jìn)行進(jìn)一步純化,或進(jìn)行梯度稀釋,以確定最佳的模板濃度。
3)電泳中出現(xiàn)拖帶現(xiàn)象的原因:
1)可能是電壓設(shè)置過高,電泳效果受到多種因素影響,電壓過高可能對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成負(fù)面影響。建議適當(dāng)降低電壓進(jìn)行試驗(yàn)。
2)上樣量過多也會(huì)導(dǎo)致拖帶現(xiàn)象,嘗試回收樣品后按照1:50或1:100的比例進(jìn)行稀釋,然后重新擴(kuò)增。
二、引物問題:
1)樣品的基因型差異可能導(dǎo)致擴(kuò)增失敗,某些引物與特定基因型結(jié)合良好,而與其他類型結(jié)合不佳。可以嘗試更換為更保守的引物進(jìn)行實(shí)驗(yàn),以提高成功率。祝順利!
2)普通PCR引物中某一條引物過量使用,若其特異性較好,通常不會(huì)對(duì)結(jié)果造成明顯影響,但如果過量的引物具備較低的特異性,有可能擴(kuò)增出非特異性條帶。
在制備單鏈探針時(shí),采用不對(duì)稱PCR的策略也是可以的,因?yàn)門aq酶在失活狀態(tài)下可能產(chǎn)生二聚體。
三、Taq酶失活:
若Taq酶活性降低,可能導(dǎo)致二聚體的產(chǎn)生,從而影響PCR結(jié)果。
四、模板濃度過低:
模板濃度過低也會(huì)影響PCR擴(kuò)增的效果。
五、退火溫度過高:
退火溫度設(shè)置過高可能導(dǎo)致擴(kuò)增效率降低,建議進(jìn)行梯度PCR實(shí)驗(yàn)以確認(rèn)最佳退火溫度。
六、循環(huán)次數(shù)不足或延伸時(shí)間過短:
循環(huán)次數(shù)過少或延伸時(shí)間不足可能導(dǎo)致目的基因的擴(kuò)增量不夠,盡管這種情況可能性較小。
七、dNTP濃度影響:
dNTP濃度過低時(shí),PCR產(chǎn)率及特異性可能提升,適用于將生物素或放射性元素標(biāo)記入擴(kuò)增產(chǎn)物。當(dāng)PCR液體中dNTP濃度達(dá)到各40μmol/L時(shí),可以合成26μg的DNA。如果不小心將量增加到原來的四倍,可能會(huì)顯著影響PCR結(jié)果,Taq酶的活力會(huì)降低20-30%,引起底物抑制。
八、PCR產(chǎn)物電泳:
1)電泳結(jié)果不清晰,可能是由于電泳緩沖液和制膠緩沖液濃度不準(zhǔn)確或受污染。可以嘗試更換新的緩沖液。
2)PCR擴(kuò)增后有時(shí)會(huì)出現(xiàn)涂抹帶、片狀帶或地毯樣帶,這通常是由于酶量過多、酶質(zhì)量差、dNTP濃度過高、Mg2+濃度過高以及退火溫度低等因素造成的。
在生物醫(yī)療領(lǐng)域,確保PCR實(shí)驗(yàn)步驟的順利進(jìn)行至關(guān)重要。通過以上的指導(dǎo),科研人員可以更有效地解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問題,提升實(shí)驗(yàn)的成功率,尤其是在使用俄羅斯專享會(huì)294品牌產(chǎn)品時(shí),能夠更好地確保結(jié)果的可靠性與準(zhǔn)確性。